HLA-A1 및 HLA-A3 T 세포 에피토프는 펩타이드 결합 모티프에서 유도된 인플루엔자 바이러스 단백질에서 예측되었습니다.

HLA 클래스 I 분자의 펩타이드 결합 모티프가 T 세포에 제시되는 바이러스 에피토프 예측에 대한 잠재적 가치는 두 가지 일반적인 HLA 대립유전자에 대해 분석되었습니다. A형 인플루엔자 바이러스에 대해 생성된 CTL은 HLA-A1에 의해 제시된 핵단백질(NP)과 기초 중합효소 1에서 유래된 펩타이드 에피토프를 인식하고, HLA-A3에 의해 제시된 NP에서 유래된 에피토프를 인식합니다. 각 클래스 I 분자에 대해 고유한 앵커 잔기로 특성화된 펩타이드 결합 모티프가 내재된 펩타이드의 서열을 기반으로 이전에 확인되었습니다: HLA-A1의 경우 위치 3 = Asp 또는 Glu, 위치 9 = Tyr; HLA-A3의 경우 위치 2 = Leu, 위치 9 = Lys 또는 Tyr. HLA-A1 결합 모티프를 포함하는 6개의 펩타이드가 NP 및 기초 중합효소 1 단백질의 서열 내에서 확인되었고, HLA-A3 모티프를 포함하는 한 개의 펩타이드가 NP 분자에서 확인되었습니다. 6개의 HLA-A1 펩타이드 중 3개와 1개의 HLA-A3 NP 펩타이드는 각각 in vitro 펩타이드 결합 분석에서 HLA-A1 또는 HLA-A3에 결합할 수 있었습니다. HLA-A1 결합 펩타이드 중 2개는 HLA-A1에 의해 제한된 인플루엔자 바이러스 면역 CTL 집단에 의해 용해를 위해 표적 세포를 감작시킬 수 있었고, HLA-A3 NP 펩타이드 1개(NP 265-273 ILRGSVAHK)는 HLA-A3에 의해 제한된 인플루엔자 면역 CTL에 의해 용해를 위해 표적 세포를 감작시킬 수 있었습니다. 각 펩타이드는 또한 in vitro에서 펩타이드 특이적인 클래스 I 제한 CTL을 유도할 수 있는 것으로 나타났으며, 이 펩타이드 중 두 가지에 대해 생성된 CTL은 바이러스 감염된 표적을 특정적으로 인식할 수 있었습니다. 따라서 이러한 펩타이드 결합 모티프는 항바이러스 T 세포 매개 면역 반응을 유도할 수 있는 면역원성 합성 에피토프를 구축하는 데 사용될 수 있습니다.