新規の大規模コピー数変異率と選択

コピー数変異（CNV）は活発な研究分野ですが、人間集団における新規変異率は十分に特定されていません。大規模（>100 kbp）イベントに焦点を当てることで、神経認知疾患の有無にかかわらず人間の系譜からの4394回の伝達を分析することにより、人間における新規CNV形成の率を推定します。ゲノム全体のCNV変異を直接測定する際の重要な制約は、細胞株ではなく一次組織由来のDNAにアクセスすることです。喘息の三人組から得た全血由来のDNAを分析するために単一ヌクレオチド多型（SNP）マイクロアレイを用いて、保守的にゲノム全体のCNV変異率を推定し、大規模CNVの有病率の上昇は観察されませんでした。約30 kbの解像度で、772回の伝達から9つの新規CNVが観察され、これは伝達あたりのゲノムごとのCNV変異率μ = 1.2 × 10(-2)を示しています（CNV >500 kbの場合、μ = 6.5 × 10(-3)）。以前のCNV有病率の推定と変異選択平衡モデルを仮定すると、ゲノム全体レベルでの大規模イベント（>500 kb）に対する重要な浄化選択をs = 0.16と推定します。これを支持して、AGREコレクションの717の多重自閉症系譜において新規CNVを特定し、多重自閉症の症例と影響を受けていない兄弟の間で新規CNVの四重の富化（P = 1.4 × 10(-3)）を観察し、多くの新規CNV変異が自閉症に対する微細だが重要なリスクに寄与することを示唆しています。研究されたコホートの中でCNVの起源や伝達に親の偏りは観察されませんでした。