Os resíduos de guanina em d(T2AG3) e d(T2G4) formam G-quadruplexos estabilizados por cátions de potássio com ângulos de torção glicosídica anti em solução

Relatamos abaixo estudos de RMN de prótons da estrutura do G-quadruplexo formada pela sequência telomérica humana d(T2AG3) e pela sequência telomérica de tetrahymena d(T2G4) em uma solução contendo cátions de K. Observamos espectros de RMN de prótons bem resolvidos correspondentes a uma conformação de monômero de G-quadruplexo predominante a uma concentração de cátions de K de 50 mM e a uma conformação de dímero de G-quadruplexo predominante a uma concentração de cátions de K de 300 mM. Em contraste, d(T2AG3T) e d(T2G4T) formam apenas as estruturas de monômero de G-quadruplexo independentemente da concentração de cátions de K, conforme relatado anteriormente por Sen, D., & Gilbert, W. (1992) Biochemistry 31, 65-70. Detectamos ressonâncias bem resolvidas para os prótons imino e amino de guanina intercambiáveis envolvidos na formação do G-tetrado, com os prótons amino ligados por ligações de hidrogênio e expostos separados por até 3,5 ppm. Os NOEs observados entre os prótons amino e H8 em guaninas adjacentes dentro de tetrados individuais apoiam o alinhamento de emparelhamento de Hoogsteen ao redor do tetrado. Os prótons imino dos G-tetrados internos trocam muito lentamente com o solvente H2O nos quadruplexos d(T2AG3) e d(T2G4). A natureza e a intensidade dos padrões de NOE observados estabelecem a formação de G-quadruplexos em paralelo em formato destro com todos os ângulos de torção glicosídica de guanina anti. Um modelo para o G-quadruplexo em paralelo é proposto, que é consistente com os dados experimentais de NOE sobre os quadruplexos d(T2AG3) e d(T2G4) em solução.(RESUMO TRUNCADO EM 250 PALAVRAS)