進行したノーマ病変における一般的な細菌種と新しい系統群

本研究の目的は、文化に依存しない分子方法を用いて進行したノーマ病変における細菌多様性を特定することでした。ナイジェリアの四人の子供から分離した進行したノーマ病変のDNAから、16SリボソームDNA細菌遺伝子が普遍的に保存されたプライマーおよびスピロヘータ選択プライマーを用いてPCR増幅され、大腸菌にクローニングされました。212のクローニングインサートから約500塩基の部分的16S rRNA配列を用いて、既知の種または系統群の配列との比較により、種の同定または最も近い親戚を特定しました。潜在的に新しい種のほとんどについて、約1,500塩基のほぼ完全な配列が得られました。合計で67の細菌種または系統群が検出され、そのうち25種はまだin vitroで増殖されていません。Propionibacterium acnes、Staphylococcus spp.、および機会病原体であるStenotrophomonas maltophiliaおよびOchrobactrum anthropiを含む19の種または系統群は、複数の被験者で検出されました。検出された他の既知の種には、Achromobacter spp.、Afipia spp.、Brevundimonas diminuta、Capnocytophaga spp.、Cardiobacterium sp.、Eikenella corrodens、Fusobacterium spp.、Gemella haemoylsans、およびNeisseria spp.が含まれていました。ノーマ感染に特有の系統群には、Eubacterium、Flavobacterium、Kocuria、Microbacterium、Porphyromonasの属および関連するStreptococcus salivarius、Sphingomonas、TREPONEMAの属が含まれました。進行したノーマ病変は環境に開かれた感染であるため、土壌など口腔には一般的に関連付けられない種が検出されたことは驚きではありませんでした。スピロヘータやFusobacterium spp.など、ノーマの潜在的な病原体として以前に示唆されたいくつかの種が、少なくとも一人の被験者で検出されました。ただし、利用可能なノーマ被験者の数が限られているため、この時点では特定の種と病気を関連付けることはできませんでした。