खमीर ADR1 के जिंक फिंगर डोमेन की समाधान संरचना

"जिंक फिंगर" एक 30-आधार पुनरावृत्त मोटिफ है जिसे विभिन्न यूकेरियोटिक ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर्स में पहचाना गया है। प्रत्येक डोमेन एक Zn2+ आयन को अपरिवर्तनीय Cys और His अवशेषों के माध्यम से बांधने में सक्षम है। हमने एक सिंथेटिक पेप्टाइड की थ्री-डाइमेंशनल संरचना निर्धारित की है जो खमीर ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर ADR1 में दो जिंक फिंगर डोमेन में से एक के अनुरूप है, दो-आयामी नाभिकीय चुंबकीय विवर्तन spectroscopy का उपयोग करके। पेप्टाइड की Zn2(+)-बांधित संरचना में दो Cys अवशेषों वाला एक लूप, एक "फिंगरटिप," दो His अवशेषों वाला 12-से 13-आधार अल्फा-हेलिक्स और एक C-टर्मिनल पूंछ शामिल है। देखे गए अंतरों के बीच संपर्कों में से अधिकांश प्रोटोटाइपिक जिंक फिंगर के सात संरक्षित अवशेषों में शामिल हैं (अर्थात, चार जिंक लिगैंड और तीन हाइड्रोफोबिक अवशेष), जो दर्शाता है कि ये अवशेष डोमेन की तीन-आयामी संरचना के लिए बड़े पैमाने पर जिम्मेदार हैं और कि TFIIIA वर्ग के सभी जिंक फिंगर डोमेन समान संरचनाएँ रखेंगे। संभावित DNA-बांधने वाले अवशेष पूरे संरचना में पाए जाते हैं, जिनमें अल्फा-हेलिक्स के बाहरी चेहरे पर ऐसे अवशेषों का उच्चतम घनत्व होता है।