जीनोम फ़िलोजेनी पर रेटिकुलेट विकास का प्रभाव

जीनोम फ़िलोजेनी का उपयोग जीनोमों के बीच विकासात्मक संबंधों के पेड़ के समान प्रतिनिधित्व बनाने के लिए किया जाता है। हालाँकि, एक सेट के भीतर फ़िलोजेनी संकेतों को एक ही पेड़ में संकुचित करने में, ये विधियाँ आमतौर पर पार्श्व आनुवंशिक अंतरण के कारण उत्पन्न असंगत संकेतों को स्पष्ट रूप से ध्यान में नहीं रखती हैं। चूंकि विवादास्पद ऊर्ध्वाधर और क्षैतिज संकेत सामंजस्यपूर्ण पेड़ उत्पन्न कर सकते हैं जो किसी भी प्रकार के इतिहास को नहीं दर्शाते, यह समझना आवश्यक है कि अनुमानित जीनोम फ़िलोजेनीयों की असंगत प्रभावों के प्रति संवेदनशीलता क्या है। जीनोम विकास के पुनरुत्पादित अनुकरणों का उपयोग करते हुए, हम दिखाते हैं कि पार्श्व आनुवंशिक अंतरण के विभिन्न परिदृश्यों का "सच्चे" जीनोम पेड़ को पुनः प्राप्त करने की क्षमता पर महत्वपूर्ण प्रभाव पड़ता है, भले ही फ़िलोजेनी असंगत संकेतों के लिए सुधार किए जाएं।