海洋プランクトン古細菌はアミノ酸を取り込む

古細菌は伝統的に「極限環境微生物」と考えられてきましたが、最近の研究により、海洋プランクトン古細菌が海中の微生物群集の驚くべき割合を占めていることが示され、総細菌の最大60%に達することが分かりました。しかし、古細菌の基本的な生理学とコミュニティ微生物活性への寄与は未だ不明のままです。私たちは、北西地中海とカリフォルニア近海の太平洋の200m深さから古細菌を調査し、基質追跡オートラジオグラフィーフルオレッセンス in situ ハイブリダイゼーション（STARFISH）という手法を用いて、自然の条件下（8～17度C、暗所で酸素を加えた）での古細菌の活動を測定しました。この手法は、16S rRNAプローブ結合による特定の細胞タイプの同時検出と、微オートラジオグラフィーによる活動測定を行います。200m深の地中海および太平洋のサンプルでは、古細菌プローブに結合する細胞は、それぞれ合計計測可能な細胞の約43%と14%を占めました。私たちの結果は、古細菌が自然濃度（ナノモーラー）の溶存アミノ酸の取り込みにおいて活発であり、古細菌群集の約60%が測定可能な取り込みを示していることを示しました。バクテリアも同様の活性細胞の割合を示しました。私たちは、これらの古細菌の一部が従属栄養性であり、同じ水中でバクテリアと共存していることを確認しました。