FlyTF: anotação aprimorada e funcionalidadeenhanced da base de dados de fatores de transcrição de Drosophila

FlyTF (http://www.flytf.org) é um banco de dados de fatores de transcrição (TFs) específicos de sítio preditos computacionalmente e/ou verificados experimentalmente na mosca da fruta Drosophila melanogaster. A classificação manual dos TFs na versão inicial do FlyTF, que se concentrava principalmente nas características de ligação ao DNA das proteínas, agora foi ampliada para uma anotação mais detalhada tanto das propriedades de ligação ao DNA quanto das propriedades regulatórias na nova versão. Além disso, evidências experimentais da literatura foram classificadas em um vocabulário definido e, em colaboração com o FlyBase, traduzidas em anotação de Gene Ontology (GO). Embora nossas anotações de GO também estejam disponíveis através do FlyBase, pois serão incorporadas à anotação oficial de GO dos genes no futuro, toda a evidência utilizada para a classificação, incluindo previsões computacionais e citações da literatura, pode ser acessada através do FlyTF. O site do FlyTF agora se baseia na estrutura do InterMine, que fornece aos biólogos experimentais e computacionais uma poderosa funcionalidade de busca e filtragem, ferramentas de gerenciamento de listas e acesso a informações genômicas associadas aos TFs.