मिथैनोकोकस मारिपालुडिस से राडए रीकॉम्बिनेज़ में एक रूपात्मक स्विच का संरक्षण

आर्कीयल राडए ईयूकेेरियाल राड51 के निकट समरूप होते हैं (लगभग 40% अनुक्रम पहचान)। ये रीकॉम्बिनेज़ ATP हाइड्रोलिसिस को बढ़ावा देते हैं और समरूप एकल-पैठी और डबल-पैठी DNA सब्सट्रेट के बीच एक प्रमुख स्ट्रैंड-एक्सचेंज प्रतिक्रिया को उत्प्रेरित करते हैं। क्षतिग्रस्त DNA पर स्थित 3'-ओवरहैंग्स का समरूप डबल-पैठी DNA के साथ जोड़ना क्षतिग्रस्त क्षेत्र के पुनः-सं синथेसिस को सक्षम करता है, जिसमें समरूप DNA को टेम्पलेट के रूप में प्रयोग किया जाता है। हाल के अध्ययनों में, मिथैनोकोकस वोल्टाई राडए के DNA-इंटरेक्टिंग क्षेत्रों में रूपात्मक परिवर्तन ATPase केंद्र में सक्रियता-उत्तेजक पोटेशियम या कैल्शियम आयनों की उपस्थिति से संबंधित रहे हैं। यहां प्रस्तुत M. maripaludis राडए के क्रिस्टल संरचनाओं की श्रृंखला ATPase केंद्र में एक ऑलस्टेरिक स्विच के संरक्षण का सुझाव देती है जो DNA-इंटरेक्टिंग लूप्स की रूपात्मक स्थिति को नियंत्रित करता है। दूरस्थ एस्चेरिचिया कोलाई रेकए होमो लोग के साथ संरचनात्मक तुलना इस धारणा का समर्थन करती है कि रेकए में संरक्षित लिस248 और लिस250 अवशेष राडए में कैशन की भूमिका निभाते हैं। DNA-इंटरेक्टिंग L2 क्षेत्र और ATP के टर्मिनल फॉस्फेट के बीच एक कैशनिक ब्रिज का संरक्षण, साथ ही न्यूक्लियोक्रीस्टीन फिलामेंट की स्पष्ट स्थिरता, एक गैप-डिस्प्लेसमेंट मॉडल का सुझाव देती है जो DNA-स्ट्रैंड एक्सचेंज के लिए ATP हाइड्रोलिसिस के लाभ को स्पष्ट कर सकती है।