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베이지안 추론은 복잡한 진화 모델을 활용하여 대규모 데이터 세트를 신속하게 분석할 수 있기 때문에 계통발생 추정에 대한 일반적인 통계적 접근 방식이 되고 있습니다. 편리하게도, 베이지안 계통발생 방법은 현재 사용 가능한 서열 진화의 확률적 모델을 사용합니다. 그러나 다른 모델 기반 접근 방식과 마찬가지로, 베이지안 추론의 결과는 가정된 진화 모델에 따라 달라집니다: 부적합한 모델(데이터에 잘 맞지 않는 모델)은 잘못된 추론을 초래할 수 있습니다. 본 논문에서는 사후 예측 분포를 사용하여 진화 모델의 적합성을 평가하는 베이지안 계통발생 방법을 제시합니다. 모델의 사후 예측 성능을 평가함으로써 베이지안 계통발생 연구를 위한 적합한 모델을 선택할 수 있습니다. 계통발생 모델의 전반적인(글로벌) 성능을 평가하는 단일 테스트 통계량을 제시하지만, 특정 기능(로컬 성능)을 평가하고 실패의 원인을 식별하기 위해 다양한 테스트 통계량을 조정할 수 있습니다. 여기에서 제시된 방법은 우도비 검정 및 비모수 부트스트랩과 달리 계통발생 및 모델 매개변수의 불확실성을 고려합니다.
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Jonathan P. Bollback
University of Liverpool
Molecular Biology and Evolution
University of Rochester
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Jonathan P. Bollback(몬,)은 이 질문을 연구했습니다.
synapsesocial.com/papers/6a1d383fba3016ff712f4540 — DOI: https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a004175
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