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न्यूक्लिक एसिड बेस और अन्य हेटेरोसाइक्ल्स की आणविक इलेक्ट्रॉनिक संरचना का वर्णन करने के लिए, हम एटমিক ऑर्बिटल्स (LCAO) के लीनियर कॉम्बिनेशन विधि का उपयोग करते हैं, आणविक तरंग फ़ंक्शन को सभी वैलेंस ऑर्बिटल्स का लीनियर कॉम्बिनेशन मानते हुए, अर्थात्, C, N और O परमाणुओं के लिए 2s, 2px, 2py, 2pz ऑर्बिटल और H परमाणुओं के लिए 1s ऑर्बिटल। विकर्ण मैट्रिक्स तत्वों (जिसे ऑन-साइट ऊर्जा भी कहा जाता है) के संदर्भ में, हम एक नवीनतम पैरामीटराइजेशन पेश करते हैं। पड़ोसी परमाणुओं के लिए गैर-विकर्ण मैट्रिक्स तत्वों के संदर्भ में, हम स्लेटर–कोस्टर दो-केंद्र अंतःक्रिया ट्रांसफर इंटीग्रल का उपयोग करते हैं। हम हैरिसन-प्रकार के अभिव्यक्तियों का उपयोग करते हैं जिनके कारक मूल के सापेक्ष थोड़ा संशोधित होते हैं। हम हेटेरोसाइक्ल्स की आयननकरण और उत्तेजना ऊर्जा के लिए अपने LCAO भविष्यवाणियों की तुलना करते हैं जो कि आयननकरण संभाव्यता संतुलित क्लस्टर के साथ सिंगल और डबल (IP-EOMCCSD)/aug-cc-pVDZ सिद्धांत स्तर से प्राप्त होते हैं और पूरी तरह से सामान्यीकृत संतुलित क्लस्टर के साथ सिंगल, डबल और गैर-आवर्ती ट्रिपल (CR-EOMCCSD(T))/aug-cc-pVDZ स्तर के सिद्धांत, क्रमशः, (ऊर्ध्वाधर मान), के साथ-साथ उपलब्ध प्रयोगात्मक डेटा के साथ। इसी तरह, हम अगले बेस जोड़ों के बीच ट्रांसफर इंटीग्रल की गणना करते हैं, जिसका उपयोग चार्ज ट्रांसफर और उत्तरण के लिए एक टाइट-बाइंडिंग (TB) वायर मॉडल विवरण में किया जाएगा, जैसा कि आदर्श या विरूपित B-DNA के साथ है। सभी वैलेंस ऑर्बिटल्स को ध्यान में रखते हुए, हम समतल ज्यामिति से विचलन को संभालने की स्थिति में हैं, जैसे कि DNA संरचनात्मक विविधता, जो कि समतल ह्यूकेल दृष्टिकोण (यानी, केवल 2pz ऑर्बिटल का उपयोग करना) के लिए असंभव है। हम परमाणु गतिशीलता द्वारा विकसित 20mer का उपयोग करके संरचनात्मक रूपांतरणों के प्रभाव को दर्शाते हैं।
Mantela et al. (Mon,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।