कैंसर रोगियों में पीडी-1 अवरोधन से उपचारित माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता और उच्च ट्यूमर म्यूटेशन बोझ की गैर-आक्रामक पहचान

सारांश उद्देश्य: माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता (MSI) और उच्च ट्यूमर म्यूटेशन बोझ (TMB-High) अनुभवी पैन-ट्यूमर बायोमार्कर हैं जिनका उपयोग प्रतिरक्षा जांच अवरोधन के उपचार के लिए रोगियों का चयन करने के लिए किया जाता है; हालाँकि, अप्रसाध्य या मेटास्टेटिक ठोस ट्यूमर का वास्तविक समय अनुक्रमण अक्सर चुनौतीपूर्ण होता है। हम रोगियों के संचारण में MSI और TMB-High की पहचान के लिए एक गैर-आक्रामक दृष्टिकोण की रिपोर्ट करते हैं। प्रयोगात्मक डिज़ाइन: हमने एक दृष्टिकोण विकसित किया जो लक्षित माइक्रोसैटेलाइट क्षेत्रों सहित हाइब्रिड-कैप्चर-आधारित 98-kb पैन-कैंसर जीन पैनल का उपयोग करता था। दुर्लभ MSI फ्रेमशिफ्ट एलील्स की पहचान के लिए एक बहु-कारक गलती सुधार विधि और एक नए पीक-फाइंडिंग एल्गोरिदम की स्थापना की गई। परिणाम: स्वस्थ दाताओं और मेटास्टेटिक कैंसर वाले रोगियों से प्राप्त cfDNA के विश्लेषण के माध्यम से, गलती सुधार और पीक-फाइंडिंग दृष्टिकोणों ने क्रमशः MSI और TMB-High के लिए 99% (n = 163) की विशिष्टता और 78% (n = 23) और 67% (n = 15) की संवेदनशीलता का उत्पादन किया। PD-1 अवरोधन से उपचारित रोगियों के लिए, हमने प्रदर्शित किया कि प्रीट्रीटमेंट प्लाज्मा में MSI और TMB-High ने प्रगति-रहित जीवित रहने की भविष्यवाणी की (खतरनाक अनुपात: 0.21 और 0.23, P = 0.001 और 0.003, क्रमशः)। इसके अलावा, हमने थेरेपी के दौरान प्राप्त लंबे समय से एकत्रित प्लाज्मा नमूनों से cfDNA का विश्लेषण किया ताकि उन रोगियों की पहचान की जा सके जिन्होंने PD-1 अवरोधन के प्रति स्थायी प्रतिक्रिया प्राप्त की। निष्कर्ष: ये विश्लेषण गैर-आक्रामक पैन-कैंसर स्क्रीनिंग और उन रोगियों की निगरानी की व्यवहार्यता दिखाते हैं जो MSI या TMB-High प्रदर्शित करते हैं और जिनका प्रतिरक्षा जांच अवरोधन का जवाब देने की उच्च संभावना है। वांग और अजानी द्वारा संबंधित टिप्पणी देखें, p. 6887