Uma nova sequência de DNA de rato moderadamente repetitiva detectada por um DNA clonado de 4,5 SI.

O RNA 5 SI é um RNA nuclear pequeno, abundante e não cap, encontrado em células de roedores. O RNA 4,5 SI tem 98 ou 99 nucleotídeos de comprimento e não contém nucleotídeos modificados; é sintetizado pela RNA polimerase III, é parcialmente ligado por ligações de hidrogênio ao hnRNA poli(A+), e foi o primeiro RNA nuclear pequeno a ser purificado e sequenciado (Busch, H., Reddy, R., Ruthblum, L., e Choi, Y. C. (1982) Annu. Rev. Biochem. 51, 617-654). Em estudos sobre a estrutura e organização dos genes que codificam para esse RNA abundante, foi encontrado que este RNA é homólogo a uma família aparentemente nova de sequências repetitivas. Dois clones foram caracterizados; um clone mostrou que sua sequência é idêntica ao RNA nos primeiros 92 resíduos e diferiu apenas nos últimos seis nucleotídeos. Além disso, a extremidade 3'-do fragmento continha uma região rica em A e T, e a sequência estava flanqueada por uma repetição direta de 15 nucleotídeos de AAAATATAGACACTG. O segundo clone caracterizado continha sequências de nucleotídeos 1-57 correspondentes ao RNA e estava flanqueado por uma repetição direta de 15 nucleotídeos. As características estruturais desses dois DNAs são consistentes com a síntese mediada por RNA e a integração desse DNA no genoma em locais aleatórios. Estima-se que existam cerca de 10.000 cópias dessa família de sequências no genoma haploide do rato.