model.it : construindo modelos tridimensionais de DNA a partir de dados de sequência

SEM RÓTULO: Um servidor WWW é descrito para criar modelos 3D de DNA canônico ou dobrado a partir de dados de sequência. A trajetória prevista do DNA é primeiro calculada com base na escolha de modelos de di- e trinucleotídeos (M.G. Munteanu et al., Trends Biochem. Sci. 23, 341-347, 1998); um modelo atômico é então construído e opcionalmente minimizado em energia com dinâmica molecular restrita. Os dados são apresentados como um arquivo PDB padrão, visualizável diretamente no PC do usuário usando qualquer programa de manipulação de moléculas. DISPONIBILIDADE: O servidor model.it está disponível gratuitamente em http://www.icgeb.trieste.it/dna/ CONTATO: kristian@icgeb.trieste.it; pongor@icgeb.trieste.it INFORMAÇÕES SUPLEMENTARES: uma série de arquivos de ajuda está disponível no endereço acima.