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As características moleculares do vírus da diarreia viral bovina (BVDV), um membro do gênero Pestivirus atualmente classificado na Togaviridae, foram examinadas em busca de características que se assemelham às da família Flaviviridae. Assim como os flavivírus, o BVDV possui um genoma de RNA de fita simples (aprox. 4.3 x 10(6) Mr) deficiente em um trecho 3' poli(A). Esse RNA possui uma única estrutura de leitura aberta que abrange o comprimento do genoma na orientação do RNA viral (polaridade positiva), implicando em uma estratégia de expressão que envolve o processamento de uma poliproteína precursora. Com exceção de vários trechos curtos, mas significativos, de aminoácidos idênticos dentro de duas proteínas não estruturais, não foram observadas regiões extensas de homologia de sequência de nucleotídeos ou aminoácidos entre o BVDV e representantes de três subgrupos sorológicos de flavivírus transmitidos por mosquito. No entanto, a comparação da organização de domínios codificadores de proteínas ao longo dos genomas e dos perfis hidropáticos das sequências de aminoácidos revelou semelhanças pronunciadas. Propõe-se que o Pestivirus, do qual o BVDV é o membro protótipo, não deve mais ser agrupado na família Togaviridae, mas sim considerado um gênero de vírus não transmitidos por artrópodes dentro da Flaviviridae.
Collett et al. (Sat,) estudaram essa questão.