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次世代シーケンシングデータからの変異を検出する際の重要なステップは、計算ツールによって呼び出されたり予測されたりする仮定の変異の事後フィルタリングです。ここでは、呼び出された単一ヌクレオチド変異および挿入/欠失の精度を高める可能性のある4つの重要なパラメータを強調します:品質と深さ、初期マッピングの洗練と改善、アレル/ストランドのバランス、そして虚偽の遺伝子の検査です。これらの配列特徴を変異フィルタリングに適切に使用することで、バリデーション率を大幅に向上させ、次世代シーケンシングプロジェクトの時間とコストを節約することができます。
Jia et al. (Fri,)がこの問題を研究しました。
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