Molekulare Struktur des G.A Basenpaares in DNA und ihre Implikationen für den Mechanismus von Transversions-Mutationen.

Das synthetische Deoxydodecamer d(C-G-C-G-A-A-T-T-A-G-C-G) wurde durch Röntgenbeugungsmethoden analysiert, und die Struktur wurde auf einen Residualfehler von R = 0,17 bei einer 2,5-Å-Auflösung (2 Sigma-Daten) mit 83 lokalisierten Wassermolekülen verfeinert. Die Sequenz kristallisiert als eine volle Umdrehung einer B-DNA-Helix und enthält 2 Purin-X-Purin (G.A) Basenpaare und 10 Watson-Crick-Basenpaare. Die Analyse zeigt schlüssig, dass Adenin in der syn Orientierung in Bezug auf die Zuckergruppe vorliegt, während Guanin die übliche trans Orientierung annimmt. Stickstoffatome beider Basen sind in Wasserstoffbrückenbindungen mit dem N-1 von Guanin 2,84 Å von dem N-7 von Adenin und dem N-6 von Adenin innerhalb von 2,74 Å vom O-6 von Guanin involviert. Die C-1'...C-1' Trennung beträgt 10,7 Å, was nahe an dem für Standard-Watson-Crick-Basenpaaren liegt. Die Einwerfung der Purin-Purin-Basenpaare an zwei Stellen im Dodecamer verursacht nur geringe Störungen der lokalen oder globalen Konformation der Doppelhelix. Der Vergleich der Strukturmerkmale mit denen des G.T Wobble-Paares und des Standard G.C-Paares legt eine Begründung für die differenzielle enzymatische Reparatur der beiden Arten von Basenpaar-Unstimmigkeiten nahe.