アラビドプシス・タリアナの開花時刻遺伝子座周辺の染色体領域におけるハプロタイプ構造と表現型の関連 この記事の配列データは、アクセッション番号 AY781906、AY785055 として EMBL/GenBank データライブラリに登録されています。

アラビドプシス・タリアナにおける自然変異に基づく遺伝子座のファインマッピングにおける連鎖不均衡（LD）の使用可能性は、開花時刻と、自然変異に寄与することが知られている二つの候補遺伝子（FRI および FLC）が含まれるゲノム領域におけるマーカー多型との関連を調べることによって検討されました。196 の系統サンプルが使用され、約 500 bp の断片 17 個を配列決定することによって多型が評価されました。ハプロタイプの類似性に基づく新しいベイズアルゴリズムを使用して、LD を用いて FRI 遺伝子を約 30 kb の領域にファインマッピングし、二つの共通した機能喪失アレルを特定できたことを示します。興味深いことに、遺伝的異質性のために、単純な単一マーカー関連分析では FRI をほぼ同じ精度でマッピングすることはできなかったでしょう。いずれの座にも以前知られていなかったアレルの明確な証拠は見つかりませんでしたが、偽陽性を引き起こす集団構造の影響は明らかでした。