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FUNDAMENTOS: A dieta é um dos principais fatores que influenciam a estrutura e composição da comunidade microbiana do intestino grosso equino. O objetivo deste estudo foi caracterizar as mudanças na microbiota fecal de cavalos em pastagem durante as transições entre tipos de forragem dentro de sistemas integrados de pastoreio rotacionado de gramíneas de estação quente (WSG) e de estação fria (CSG). Oito éguas foram aleatoriamente designadas para dois sistemas de pastoreio rotacionado integrados contendo gramíneas mistas de estação fria e uma de duas gramíneas de estação quente: bermudagrass Cynodon dactylon (L.) Pers. ou crabgrass Digitaria sanguinalis (L.) Scop.. Amostras fecais foram coletadas durante as transições de seções de pastagem de CSG para WSG (C-W) e de WSG para CSG (W-C) nos dias 0, 2, 4 e 6 após a rotação da pastagem e comparadas usando sequenciamento do gene 16S rRNA. RESULTADOS: ≥ 0,24; P = 0,0001). A modelagem de floresta aleatória não conseguiu prever com precisão os dias dentro de C-W e W-C, mas pude prever o cavalo individual com base na composição microbiana (precisão: 0,92 ± 0,05). Apenas três grupos de co-abundância bacteriana diferencialmente abundantes (BCG) foram identificados em todos os dias dentro de todos os C-W e W-C para ambos os IRS (W ≥ 126). O BCG que diferiu por dia para todas as transições incluiu variantes de sequência de amplicon (ASV) atribuídas a grupos bacterianos com funções conhecidas de fibroálise e produção de butirato, incluindo membros da Lachnospiraceae, Clostridium sensu stricto 1, Anaerovorax, o grupo NK4A214 de Oscillospiraceae e Sarcina maxima. Em comparação, 38 BCG foram identificados como diferencialmente abundantes por cavalo (W ≥ 704). As ASVs nesses grupos foram mais frequentemente atribuídas a gêneros associados à degradação de carboidratos estruturais, incluindo o grupo RC9 do Rikenellaceae, Treponema, o grupo R-7 do Christensenellaceae e o grupo NK4A214 de Oscillospiraceae. O pH fecal também não diferiu por dia. CONCLUSÕES: No geral, esses resultados demonstraram uma forte influência do cavalo individual na comunidade microbiana fecal, particularmente na composição específica de degradadores de fibra. A microbiota fecal equina foi amplamente estável durante as transições entre as forragens dentro do IRS, sugerindo que a microbiota intestinal equina se ajustou em nível individual às sutis mudanças dietéticas impostas por essas transições. Essa capacidade adaptativa indica que os cavalos podem ser manejados em IRS sem induzir disfunções gastrointestinais.
Weinert-Nelson et al. (Ter,) estudaram essa questão.