Kristallographische Analyse des Komplexes zwischen Triosephosphat-Isomerase und 2-Phosphoglycolat bei 2,5-Å Auflösung: Auswirkungen auf die Katalyse

Die Bindung des Übergangszustandsanalogons 2-Phosphoglycolat an Triosephosphat-Isomerase aus Hefe wurde kristallographisch untersucht. Ein atomarem Modell des Enzym-Inhibitor-Komplexes wurde gegen Daten mit 2,5-Å Auflösung auf einen endgültigen R-Faktor von 0,18 verfeinert. Die Interaktionen zwischen dem Inhibitor und dem Enzym wurden analysiert. Der Inhibitor bildet Wasserstoffbrücken zu den Seitenketten von His 95 und Glu 165. Die letztere Wasserstoffbrücke bestätigt, dass Glu 165 bei der PGA-Bindung protoniert ist. Die Struktur des komplexierten Enzyms wurde mit der ungebundenen Form des Enzyms verglichen, und es wurden konformationale Änderungen beobachtet: die Seitenkette von Glu 165 bewegt sich über 2 Å und eine 10-Aminosäuren flexible Schleife bewegt sich über 7 Å, um den aktiven Ort zu schließen. Spektroskopische Ergebnisse zur Bindung von Phosphoglycolsäure an Triosephosphat-Isomerase, die im Laufe der Jahre gesammelt wurden, werden ebenfalls in strukturellen Begriffen erklärt. Die Auswirkungen auf die Katalyse werden hervorgehoben.