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Los estudios genómicos de la expresión génica bacteriana están pasando de la tecnología de microarrays a plataformas de secuenciación de segunda generación. RNA-seq tiene varias ventajas sobre las técnicas basadas en hibridación, como la detección independiente de anotación de la transcripción, una mayor sensibilidad y un rango dinámico aumentado. Los primeros estudios han descubierto una gran cantidad de nuevas secuencias codificantes y ARN no codificantes, y están revelando un paisaje transcripcional que cada vez refleja más el de los eucariotas. Ya se han mejorado y adaptado los protocolos básicos de RNA-seq para examinar aspectos particulares de la biología del ARN, a menudo con un énfasis en los ARN no codificantes, y más refinamientos de las técnicas actuales mejorarán nuestra comprensión de la expresión génica y del contenido del genoma en el futuro.
Croucher et al. (Jue,) estudiaron esta cuestión.