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प्रमुख प्रकाश संश्लेषक परिसरों (photosynthetic complexes) की त्रि-आयामी संरचना के हालिया स्पष्टीकरण के बावजूद, शारीरिक परिस्थितियों में पादप क्लोरोप्लास्ट और सूक्ष्म शैवाल में प्रकाश ऊर्जा रूपांतरण की हमारी समझ के लिए प्रकाश संश्लेषण की गतिशीलता की खोज की आवश्यकता है। प्रकाश संश्लेषक उपकरण एक लचीली आणविक मशीन है जो सेकंड और मिनटों के भीतर चयापचय और प्रकाश के उतार-चढ़ाव के अनुकूल हो सकती है। लंबी समय सीमा पर, पर्यावरणीय संकेतों में परिवर्तन अनुकूलन प्रतिक्रियाओं को ट्रिगर करते हैं जो न्यूक्लियो-साइटोसोल और क्लोरोप्लास्ट के बीच इंट्रासेल्युलर सिग्नलिंग उत्पन्न करते हैं, जिसके परिणामस्वरूप प्रकाश संश्लेषक मशीनरी के बायोजेनेसिस में संशोधन होता है। यहाँ हम प्रकाश-संचयन (light-harvesting) और इलेक्ट्रॉन स्थानांतरण प्रक्रियाओं के कार्यात्मक लचीलेपन पर अच्छी तरह से स्थापित ज्ञान को, जिसे आनुवंशिक दृष्टिकोणों से बहुत लाभ हुआ है, प्रकाश संश्लेषक यूकेरियोट्स में अनुकूलन प्रतिक्रियाओं के हालिया ट्रांसक्रिप्टोमिक और प्रोटिओमिक अध्ययनों के प्रचुर डेटा के साथ एकीकृत करने का प्रयास करते हैं।
Eberhard et al. (Mon,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।
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