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表現型の変異の遺伝的源は、農業生産性の向上と適応プロセスの理解を目指した植物研究の焦点となっています。全ゲノム関連解析は、表現型と一塩基多型（SNP）との関連を調査することによって、特性の背後にある遺伝的背景を特定します。このような研究は一般的ですが、結果の生物学的解釈は依然として課題であり、特に集団構造による混乱とその結果として導入される系統的バイアスのために難しいです。ここでは、代謝モデルにエンコードされた生化学的知識を統合することにより、推測される遺伝子型から表現型へのメカニスティック解釈を提供する補完的分析（SNPeffect）を提案します。SNPeffectは、酵素コーディング遺伝子におけるSNPの結果として、A. thalianaとP. trichocarpaの系統における成長率の差異や代謝物の蓄積を説明するために使用されます。そのために、常緑の木本植物であるポプラ（Populus trichocarpa）のためのゲノムスケール代謝モデルも構築しました。予想通り、私たちの結果は、成長が炭素とエネルギーの分配によって支配される複雑な多因子特性であることを示しています。両種における機能的なSNPの予測セットは、実験的に特性を決定する遺伝子に関連しており、推測されるものも示唆しています。機能的SNPは、アミノ酸代謝、ヌクレオチド合成、およびセルロースとリグニンの合成などの経路で見つかり、炭素とエネルギーの分配を支配する経路を対象とした育種戦略と一致しています。”},{
Sarkar et al. (Fri,) studied this question.