论共转录RNA结构形成的重要性

编码和非编码基因的表达均可受到其相应转录本RNA结构特征的显著影响。目前越来越多的实验证据和部分理论证据表明，体内结构的形成始于转录过程中，且这种共转录折叠决定了正在形成的功能性RNA结构特征。数十年的生物信息学研究产生了多种用于预测RNA二级结构的计算方法。然而，就预测准确性而言，几乎所有最先进的方法都完全忽略了结构形成的过程，而仅仅关注最终的RNA结构。本综述旨在弥合这一差距。我们总结了共转录折叠的现有证据，随后综述了当前用于RNA二级结构预测的不同策略。最后，我们就如何通过明确捕获共转录结构形成过程来潜在改进现有最先进方法提出了一系列构想。