ベネットの受容比法の非正統的な使用

私たちは、ベネットの受容比法（BAR）の適用を、自由エネルギー差（熱力学的統合、指数公式）を計算するための標準的な方法が実用的でない問題に示します。私たちの出発点は、BARがしばしば、化学的自由エネルギーシミュレーションで通常用いられる（そして必要な）中間状態を必要とせずに、二つの状態間の自由エネルギー差を計算できるという観察です。これは、まず水溶液中のエタンとメタノールの間の自由エネルギー差に対して示されます。次に、BARが非常に珍しい自由エネルギー差を直接計算するためにどのように使用できるか、静電相互作用の取り扱いの変更や、フォースフィールドの切り替え、または暗黙の溶媒モデルの使用から生じる自由エネルギー差に関して示します。この種の計算は、フォースフィールドの開発および暗黙の溶媒法の検証に役立つでしょう。