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生菜（Lactuca sativa L.）是全球种植和消费最广泛的蔬菜之一，因富含对人类健康有益的植物营养素而备受重视。在此，我们通过整合来自代表性栽培生菜形态型、地方品种和野生近缘种的 12 个染色体水平基因组，报告了 Lactuca 属的高质量参考超级泛基因组，并探讨了生菜基因组的进化与驯化。这些组装展示了从 2.1 Gb 到 5.5 Gb 不等的多样化基因组大小，具有丰富的重复序列，且与低 DNA 甲基化水平相关的重复序列扩增可能是导致基因组大小变异的原因。此外，通过构建基于图谱的生菜泛基因组参考，我们探讨了结构变异的全景、基因组和表观遗传特征，并揭示了它们对基因表达和驯化的贡献。我们还在 FLOWERING LOCUS C 中鉴定了与栽培生菜延迟开花相关的拷贝数变异。总体而言，这一全面的 Lactuca 超级泛基因组组装将加速这一全球重要作物的功能基因组学研究和育种工作。
Cao et al. (Wed,) 对这一问题进行了研究。