Key points are not available for this paper at this time.
تستخدم تدفقات العمل الحالية لتحليل مجموعات بيانات الميكروبيوم متعددة الأوميكس محددة بالمختبر وغالبًا ما تؤدي إلى استخدام غير مثالي للبيانات. هنا نقدم IMP، وهو خط أنابيب قابل للتكرار ونموذجي لتحليل البيانات الميتاجنومية والميتترانسكريبتومية المدمجة والمستقلة عن المرجع. يتضمن IMP معالجة قراءة قوية مسبقة، وتجميع تكراري، وتحليل هيكل ووظيفة المجتمع الميكروبي، وتصنيف تلقائي، بالإضافة إلى التصورات القائمة على التوقيع الجيني. تعزز استراتيجية دمج البيانات المُعتمدة على IMP استخدام البيانات وحجم الناتج وجودة الناتج كما يتضح من خلال حالات الاستخدام ذات الصلة. أخيرًا، يتم تضمين IMP ضمن تنفيذ سهل الاستخدام باستخدام بايثون ودوكر. IMP متاح على http://r3lab.uni.lu/web/imp/ (ترخيص MIT).
درس نارايانا سمي et al. (Thu) هذا السؤال.