Islet Amyloid Polypeptide द्वारा एमिलॉयड निर्माण में एरोमैटिक अंतःक्रियाओं की भूमिका

एरोमैटिक-एरोमैटिक और एरोमैटिक-हाइड्रोफोबिक अंतःक्रियाओं को islet amyloid polypeptide (IAPP या amylin) सहित कई पॉलीपेप्टाइड्स द्वारा एमिलॉयड निर्माण में भूमिका निभाने का प्रस्ताव दिया गया है। IAPP टाइप 2 डायबिटीज के रोगियों में एमिलॉयड निर्माण के लिए जिम्मेदार है। यह पॉलीपेप्टाइड 37 अवशेष लंबा है और इसमें तीन एरोमैटिक अवशेष, Phe-15, Phe-23, और Tyr-37 शामिल हैं। ल्यूसीन में परिवर्तित सभी एकल एरोमैटिक म्यूटेंट्स, ल्यूसीन में परिवर्तित सभी डबल एरोमैटिक म्यूटेंट्स और ट्रिपल ल्यूसीन म्यूटेंट की एमिलॉयड बनाने की क्षमता की जांच की गई। वाइल्ड टाइप की तुलना में F15L म्यूटेंट के लिए एमिलॉयड निर्माण लगभग दोगुना तीव्र था, लेकिन Y37L म्यूटेंट के लिए लगभग 3 गुना धीमा और F23L म्यूटेंट के लिए लगभग 2 गुना धीमा था। प्रत्येक एकल म्यूटेंट से बने एमिलॉयड फाइब्रिल्स वाइल्ड-टाइप IAPP द्वारा एमिलॉयड निर्माण को सीडिंग करने में प्रभावी थे, जिससे यह संकेत मिलता है कि फाइब्रिल संरचनाएं समान हैं। F15L/F23L डबल म्यूटेंट का एमिलॉयड निर्माण की दर पर F15L/Y37L डबल म्यूटेंट की तुलना में अधिक प्रभाव पड़ता है, भले ही वाइल्ड-टाइप पृष्ठभूमि में Y37L प्रतिस्थापन के F23L म्यूटेशन की तुलना में अधिक गंभीर परिणाम होते हैं, जो विभिन्न साइटों के बीच गैर-योगात्मक प्रभावों का सुझाव देता है। ट्रिपल ल्यूसीन म्यूटेंट और F23L/Y37L डबल म्यूटेंट एमिलॉयड बनाने में सबसे धीमे हैं। F15 को एग्रीगेशन पाथवे के शुरुआती चरणों में महत्वपूर्ण संपर्क बनाने के लिए प्रस्तावित किया गया है, लेकिन F15L म्यूटेंट के डेटा से संकेत मिलता है कि वे इष्टतम नहीं हैं। स्थिति 15 पर प्राकृतिक और अप्राकृतिक अमीनो एसिड वाले वेरिएंट्स का एक सेट, जिन्हें हाइड्रोफोबिसिटी को संरक्षित करने, लेकिन α-helix और β-sheet प्रवृत्ति को बदलने के लिए डिज़ाइन किया गया था, का विश्लेषण इस स्थिति के उन गुणों को निर्धारित करने के लिए किया गया जो एमिलॉयड निर्माण की दर को नियंत्रित करते हैं। इस स्थिति पर β-sheet प्रवृत्ति और एमिलॉयड निर्माण की दर के बीच कोई सहसंबंध नहीं है, लेकिन α-helical प्रवृत्ति के साथ सहसंबंध है।