牛 F1-ATPase 与抗生素抑制剂 aurovertin B 复合体的结构。

在先前通过在腺苷酰亚胺基二磷酸 (AMP-PNP) 和 ADP 存在下生长的晶体测定的牛线粒体 F1-ATPase 结构中，三个催化性 beta 亚基具有不同的构象和核苷酸占据状态。腺苷酰亚胺基二磷酸结合至一个 beta 亚基 (betaTP)，ADP 结合至第二个 (betaDP)，而第三个 (betaE) 未结合核苷酸。在此，我们展示了反竞争性抑制剂 aurovertin B 在 betaTP 和 betaE 的两个等效位点结合至牛 F1，位于核苷酸结合结构域和 C 端结构域之间的裂缝中。在 betaDP 中，aurovertin B 口袋不完整且抑制剂无法进入。结合至 betaTP 的 aurovertin B 与相邻 alphaTP 亚基中的 alpha-Glu399 发生相互作用，而结合至 betaE 的 aurovertin B 距离 alphaE 过远，无法形成等效相互作用。两个位点均包含 betaArg-412，突变研究表明该残基参与结合 aurovertin。除 aurovertin 口袋周围的细微变化外，牛 F1-ATPase 的结构与先前测定的结构一致。Aurovertin B 似乎通过阻止催化界面的闭合来发挥作用，而催化界面的闭合对于涉及催化位点循环相互转化的催化机制至关重要。