Radiation avec isolement reproductif en quasi-absence de signal phylogénétique

Selon la perspective génétique, les espèces sont caractérisées par les gènes qui sous-tendent la divergence fonctionnelle. Ici, nous adoptons une approche phylogénomique pour évaluer cette perspective à l'échelle d'une radiation entière. Les hamlets (Hypoplectrus spp.) représentent une radiation récente de poissons de récif des Grandes Caraïbes qui sont isolés reproductivement par le biais de l'accouplement assorti. Un total de 335 génomes provenant de 15 sites a révélé une seule scission phylogénétique bien soutenue entre les espèces, avec une grande part de la radiation non résolue. La nature polytomique de la radiation des hamlets est extrême par rapport à d'autres radiations récentes telles que les cichlidés du lac Victoria. Au niveau de l'arbre génétique, nous avons identifié juste une région génomique, centrée autour du facteur de transcription casz1, avec une topologie qui reflète les différences entre les espèces. Ces résultats montrent que la diversification phénotypique et l'isolement reproductif — deux attributs majeurs des espèces — peuvent se développer en quasi-absence de signal phylogénétique, tant au niveau du génome qu'au niveau de l'arbre génétique.