がんにおける非コーディング薬理ゲノミクスの系統的同定

新たな証拠は、長鎖非コーディングRNA（lncRNA）ががんの薬物反応に重要な役割を果たすことを示しています。ここでは、1005のがん細胞株の多次元ゲノムデータと265の抗がん化合物の薬物反応データを統合して、lncRNA薬理ゲノミクスの風景を報告します。Elastic Net（EN）回帰を使用した分析により、27,341のlncRNA-薬物予測ペアを特定しました。2つの独立したがん薬理ゲノミクスデータセットを使用して、lncRNA ENモデルの堅牢性を検証しました。49のFDA承認薬のlncRNA ENモデルを21のがんタイプからの5605の腫瘍サンプルに適用することで、がん細胞株に基づくlncRNA ENモデルががん患者の治療結果を予測できることを示します。さらに、lncRNA-経路共発現分析により、lncRNAが薬物代謝や薬物ターゲット経路を通じて薬物反応を調節する可能性を示唆しています。最後に、Bromodomain and Extra-Terminalモチーフ（BET）阻害剤に対する最も予測力の高いlncRNAであるEPIC1が、MYC転写活性を活性化することでiBET762およびJQ-1耐性を強く促進することを実験的に検証しました。