Phylogeny of Pacific salmon and trout based on growth hormone type-2 and mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 3 DNA sequences

The phylogeny of Oncorhynchus has previously been studied using a variety of morphological and genetic characters, but two unresolved problems remain: the position of masu (Oncorhynchus masou) and amago (Oncorhynchus rhodurus) salmon and the relationships within the group containing sockeye (Oncorhynchus nerka), pink (Oncorhynchus gorbuscha), and chum (Oncorhynchus keta) salmon. We examined relationships among nine Oncorhynchus species, Atlantic salmon (Salmo salar), and lake trout (Salvelinus namaycush) using DNA sequence analyses of the mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 3 gene and a portion of the nuclear growth hormone type-2 gene. Phylogenetic trees inferred using both cladistic and distance approaches were highly concordant except in the placement of the outgroup; strong support is provided for the proposition that pink and chum salmon are sister species, and that masu and amago salmon are closer to the Pacific trout than the other Pacific salmon. The phylogeny inferred by total evidence cladistic analysis of our data combined with five different morphological, biochemical, and DNA character sets provides evidence that the common ancestor of rainbow (Oncorhynchus mykiss) and cutthroat (Oncorhynchus clarki) trout was the first to diverge from the proto-Oncorhynchus evolutionary line, which then radiated to form the seven extant Pacific salmon species. Resume : Divers chercheurs ont OtudiO antOrieurement la phylogOnie du genre Onchorhynchus en se fondant sur divers caractres morphologiques et gOnOtiques. Toutefois, deux questions demeurent ‡ ce jour sans rOponse : la position des saumons masou (Oncorhynchus masou) et amago (Oncorhynchus rhodurus) au sein du genre et les liens phylogOniques au sein du groupe renfermant les saumons rouge (Oncorhynchus nerka), rose (Oncorhynchus gorbuscha) et kOta (Oncorhynchus keta). Nous avons examinO les relations entre neuf espces du genre Oncorhynchus, le saumon atlantique (Salmo salar )e t le touladi (Salvelinus namaycush), par sOquenAage du gne encodant la sous-unitO 3 de la NADH-dOshydrogOnase mitochondriale et une portion du gne responsable de lihormone de croissance nuclOaire de type 2. Les arbres phylogOnOtiques produits ‡ liaide de liapproche cladistique et de liapproche des distances Otaient trs semblables, mis ‡ part la place rOservOe au groupe isolO; de nombreux indices nous portent ‡ croire que les saumons rose et kOta sont des espces soeurs et que les saumons masou et amago sont plus prs des truites de la cUte du Pacifique que le saumon rouge. La phylogOnie dOduite ‡ partir des analyses cladistiques de liensemble de nos donnOes et de cinq ensembles diffOrents de caractres morphologiques, biochimiques et gOnOtiques dOmontrent que liancŒtre commun de la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) et de la truite fardOe (Oncorhynchu clarki) a OtO le premier ‡ diverger de la lignOe Ovolutive proto-Oncorhynchus, qui siest ‡ son tour dissociOe pour former le groupe des sept espces de saumons du Pacifique. (Traduit par la ROdaction)