HIV-1 5' UTRの小角X線散乱由来の構造は3D tRNA模倣を明らかにする

HIVタイプ1（HIV-1）ゲノムの最も保存された領域である約335塩基対の5' UTRは、ウイルスのライフサイクルを調節する機能的なステムループドメインを特徴としています。HIV-1複製におけるこのゲノム領域の必要不可欠な性質にもかかわらず、5' UTRの多重ヘアピンドメインの3D構造は未だ不明のままです。小角X線散乱および分子動力学シミュレーションを用いて、転写活性化（TAR）/ポリA付加、プライマーバインディングサイト（PBS）、およびPsi包装ドメインの構造モデルを生成しました。TARとポリAは、高い安定性と逆転写の停止に寄与することと一致して、拡張された同軸にスタックされたヘアピンを形成します。Psiドメインは拡張されており、各ステムループは結合パートナーとの相互作用のために露出しています。PBSドメインは、アポ状態およびプライマーアニーリング状態におけるtRNAの形状に似た曲がった構造を採用します。これらの結果は、HIV-1複製の根底にあるいくつかの重要な分子メカニズムを理解するための構造的基盤を提供します。