Exploration of a plant architecture database with the AMAPmod software illustrated on an apple tree hybrid family

Ce papier décrit la constitution et l'analyse statistique d'une base de données contenant des descriptions d'architectures de plantes à l'aide du système AMAPmod. Dans AMAPmod, l'architecture des plantes est représentée par un modèle formel, nommé MTG, qui constitue la structure de données centrale du système. Un langage d'interrogation dédié, AML, permet à l'utilisateur d'accéder aux architectures des plantes à l'aide de primitives spécialisées et efficaces. En combinant ces primitives, des types de données variés permettant de préserver une part plus ou moins grande de l'information structurelle contenue dans la plante peuvent être extraits de la base de données. Des outils spécialisés ont été créés pour analyser les échantillons de données ainsi constitués. La plupart de ces outils, tant paramétriques (modèles markovien variés) que non paramétriques (algorithmes de comparaison de données fondés sur des techniques de programmation dynamique) s'appliquent à des séquences de données. La méthodologie AMAPmod est illustrée sur une base de données architecturale de taille réelle correspondant à une famille d'hybrides de pommiers.