Key result
Apramycin inhibits the bacterial RNA A-site by interacting with ribosomal protein S12.
Why the study?
The structural basis of bacterial RNA binding sites interacting with the antibiotic apramycin via glycoside pseudo base pairs and triples was unclear.
Die Struktur der A-Bindestelle bakterieller RNA im Komplex mit dem Antibiotikum Apramycin macht deutlich, wie Glycosidgerüste an der RNA-Erkennung durch Naturstoffe über die Bildung von Pseudo-Basenpaaren und -tripeln beteiligt sind. Aus der Struktur lässt sich folgern, dass die inhibierende Wirkung von Apramycin auf seiner Wechselwirkung mit dem ribosomalen Protein S12, einem Steuerelement der Ribosomentranslokation, beruht (siehe Strukturmodell).
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Han et al. (2005) studied this question. Apramycin was evaluated. The structure of the bacterial RNA A-site in complex with apramycin reveals that its inhibitory effect relies on interaction with the ribosomal protein S12 via pseudo base pairs and triples.
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