Comparaison des génomes des rotavirus simien, bovin et humain par électrophorèse sur gel et détection de la variation génomique parmi les isolats bovins

Par co-électrophorèse dans des gels de polyacrylamide, le génome segmenté à ARN double brin du rotavirus simien, SA 11, a été comparé à ceux des rotavirus humains et bovins. Une comparaison entre le virus SA 11 et le virus bovin adapté à la culture cellulaire d'Irlande du Nord a montré que les mobilités électrophorétiques de chacun des 11 segments correspondants différaient. Dans d'autres comparaisons, quatre à sept variations de segments étaient plus courantes. Lorsque les génomes de divers rotavirus bovins ont été comparés, huit électrophénotypes différents ont été détectés. Quatre de ces électrophénotypes ont été obtenus à partir d'une seule propriété lors d'une épidémie de maladie. Au vu de cette diversité génétique, un schéma pour la désignation systématique des différents échantillons de rotavirus est proposé. L'importance des variations en relation avec l'épidémiologie moléculaire des infections par rotavirus bovin est discutée.