Charakterisierung der majoren Epstein-Barr-Virus-spezifischen RNA in aus Burkitt-Lymphom abgeleiteten Zellen

Zytoplasmatische RNA, die aus fünf lymphatischen Zelllinien und einer Burkitt-Lymphom-Biopsie isoliert wurde, wurde in vitro radioaktiv markiert und mit klonierten EcoRI Restriktionsendonukleasefragmenten von B95-8 Epstein-Barr-Virus-DNA hybridisiert. Die Ergebnisse bestätigten, dass die häufigste zytoplasmatische RNA-Art in solchen Zellen durch einen kleinen Bereich des Genoms, der durch das EcoRI J-Fragment definiert ist, spezifiziert wird. Detaillierte Mapping-Experimente lokalisierten diese Transkripte präzise innerhalb der Sequenz des rechten Drittels des EcoRI J-Fragmentes. DNA-Sequenzierung deutete darauf hin, dass dieser Bereich des Epstein-Barr-Virus-Genoms nicht in der Lage ist, für Protein zu kodieren. Die majoren frühen Transkripte bestanden aus zwei nicht-polyadenylierten RNA-Arten, die jeweils etwa 170 Nukleotide lang waren. Beide wurden vom selben Strang der DNA transkribiert und zeigten signifikante Sequenzhomologie zueinander. Die kodierenden Sequenzen der beiden kleinen RNAs enthielten potenzielle intragenische Kontrollregionen für RNA-Polymerase III.