El servidor de predicción GeneMANIA: integración de redes biológicas para la priorización de genes y la predicción de la función génica

GeneMANIA (http://www.genemania.org) es una interfaz web flexible y fácil de usar para generar hipótesis sobre la función génica, analizar listas de genes y priorizar genes para ensayos funcionales. Dada una lista de consulta, GeneMANIA amplía la lista con genes funcionalmente similares que identifica utilizando datos de genómica y proteómica disponibles. GeneMANIA también informa sobre pesos que indican el valor predictivo de cada conjunto de datos seleccionado para la consulta. Seis organismos son actualmente compatibles (Arabidopsis thaliana, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Mus musculus, Homo sapiens y Saccharomyces cerevisiae) y se han recopilado cientos de conjuntos de datos de GEO, BioGRID, Pathway Commons e I2D, así como conjuntos de datos de genómica funcional específicos de organismos. Los usuarios pueden seleccionar subconjuntos arbitrarios de los conjuntos de datos asociados con un organismo para realizar sus análisis y pueden cargar sus propios conjuntos de datos para analizar. El algoritmo GeneMANIA funciona tan bien o mejor que otros métodos de predicción de función génica en benchmarks de levadura y ratón. La alta precisión del algoritmo de predicción GeneMANIA, una interfaz de usuario intuitiva y una base de datos amplia hacen de GeneMANIA una herramienta útil para cualquier biólogo.