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L'analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA) est une méthode puissante pour interpréter la signification biologique d'une liste de gènes en calculant les chevauchements avec divers jeux de gènes définis précédemment. Comme l'une des annotations les plus largement utilisées pour définir des jeux de gènes, le système de l'Ontology des gènes (GO) a été utilisé dans de nombreux outils d'analyse d'enrichissement. EasyGO et agriGO, deux kits d'outils d'analyse d'enrichissement GO développés par notre laboratoire, ont gagné une large utilisation et de nombreuses citations depuis leur publication grâce à leurs performances efficaces et leur maintenance constante. En réponse à la demande croissante d'analyses plus complètes de la part des utilisateurs, nous avons développé un serveur web comme composant important de notre boîte à outils d'analyse bioinformatique, nommé PlantGSEA, qui est basé sur la méthode GSEA et se concentre principalement sur les organismes végétaux. Dans PlantGSEA, 20 290 jeux de gènes définis provenant de différentes ressources ont été collectés et utilisés pour l'analyse GSEA. Actuellement, PlantGSEA prend en charge les IDs de locus géniques et les IDs de séries de sondes de microarrays Affymetrix de quatre espèces modèles végétales (Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Zea mays et Gossypium raimondii). PlantGSEA est un serveur web efficace et facile à utiliser, et il est maintenant accessible au public à l'adresse http://structuralbiology.cau.edu.cn/PlantGSEA.
Yi et al. (Tue,) ont étudié cette question.