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Nach den jüngsten Verbesserungen in der Sequenzierungstechnologie hat sich die Ganzgenomsequenzierung (WGS) als ein wesentliches Werkzeug zur Kontrolle der Antibiotikaresistenz positioniert, einer großen Bedrohung im modernen Gesundheitswesen. WGS hat bereits zahlreiche Anwendungen in diesem Bereich gefunden, die von der Entwicklung neuer Antibiotika und diagnostischer Tests bis hin zur Antibiotika-Überwachung der derzeit verfügbaren Medikamente durch Überwachung und Aufklärung der Faktoren reichen, die das Auftreten und die Persistenz von Resistenzen ermöglichen. Zahlreiche Machbarkeitsstudien haben auch den Wert von WGS als Werkzeug für die tägliche Infektionskontrolle hervorgehoben und für einige Krankheitserreger als primäres diagnostisches Werkzeug zur Erkennung von Antibiotikaresistenzen. Es müssen jedoch geeignete Datenanalyseplattformen entwickelt werden, bevor die routinemäßige WGS im großen Maßstab eingeführt werden kann.
Köser et al. (Sun,) haben diese Frage untersucht.
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