20种哺乳动物物种的增强子进化

哺乳动物辐射与基因组非编码区域的快速变化相对应，但我们对哺乳动物的调控进化缺乏全面的理解。在这里，我们通过分析H3K27乙酰化和H3K4三甲基化的基因组富集，追踪来自六个不同目中的20种哺乳动物物种在肝脏中活跃的启动子和增强子的进化。我们报告说，增强子的快速进化是哺乳动物基因组的普遍特征。大多数最近进化的增强子源于祖先DNA的再利用，而不是谱系特定的重复元件扩展。相比之下，几乎所有的肝脏启动子在这些物种间部分或完全保守。我们的数据进一步揭示，最近进化的增强子可以与处于积极选择下的基因相关联，展示了这种方法在注释基因组序列中的调控适应性方面的潜力。这些结果为理解哺乳动物调控进化背后的功能遗传学提供了重要见解。