Les taux d'évolution varient parmi les éléments structuraux des rRNA

Comprendre les motifs d'évolution des rRNA est crucial pour un certain nombre de domaines, y compris la prédiction de structure et la phylogénie. Le modèle standard de l'évolution de l'ARN est que les mutations compensatoires dans les tiges constituent l'essentiel des changements entre les séquences homologues, tandis que les régions non appariées sont relativement homogènes. Nous montrons qu'une hétérogénéité considérable existe dans les taux relatifs d'évolution des différentes catégories de structures secondaires (tiges, boucles, renflements, etc.) au sein de l'rRNA, et que chez les eucaryotes, les boucles évoluent en réalité beaucoup plus vite que les tiges. Les taux d'évolution et l'abondance des différentes catégories structurelles varient en fonction de la distance des parties fonctionnellement importantes du ribosome, telles que le chemin de l'ARNt et le centre de la peptidyl transférase. Par exemple, les résidus à évolution rapide se trouvent principalement à la surface ; les tiges sont enrichies à l'interface des sous-unités et aux jonctions près du centre de la peptidyl transférase. Cependant, les différentes catégories de structures secondaires évoluent à des taux différents même lorsque ces effets sont pris en compte. Les résultats démontrent que les taux relatifs et les motifs d'évolution sont spécifiques à chaque lignée, suggérant que des modèles phylogénétiquement et structurellement spécifiques amélioreront les prédictions évolutives et structurelles.