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Das komplexe Repertoire der von B- und T-Zellen erzeugten Immunrezeptoren ermöglicht die Erkennung verschiedener Bedrohungen für den Wirt. In dieser Arbeit zeigen wir, dass massives paralleles DNA-Sequenzieren von rearrangierten Immunrezeptorloci eine direkte Nachweis- und Verfolgungsmöglichkeit von immunologischer Vielfalt und erweiterten klonalen Lymphozytenpopulationen in physiologischen und pathologischen Kontexten bietet. DNA wurde aus Blut- und Gewebemustern isoliert, eine Reihe redundanter Primer wurde verwendet, um verschiedene DNA-Rearrangements zu amplifizieren, und die resultierenden Mischungen von barcodierten Ampliconen wurden mithilfe von Long-Read-Ultra-Deep-Sequencing sequenziert. Einzelne DNA-Moleküle wurden dann basierend auf DNA-Segmenten charakterisiert, die verbunden wurden, um einen funktionalen (oder nicht funktionalen) Immuneffektor zu bilden. Aktuelle experimentelle Designs können bis zu 150 Proben in einem einzigen Sequenzlauf verarbeiten, wobei die Sequenztiefe ausreicht, um stabile und dynamische Aspekte des Immunrepertoires unter normalen und kranken Umständen zu identifizieren. Diese Daten bieten ein hochauflösendes Bild der Immun-Spektren bei normalen Individuen und bei Patienten mit hämatologischen Malignomen, wobei im letzteren Fall sowohl das anfängliche Verhalten klonaler Tumorpopulationen als auch die spätere Unterdrückung oder Wiederauftreten solcher Populationen nach der Behandlung beleuchtet wird.
Boyd et al. (Wed,) haben diese Frage untersucht.