Eine genetische Basis für die Variation der Anfälligkeit von Krebs gegenüber DNA-Schäden

Die Radiotherapie wird derzeit nicht durch die genetische Zusammensetzung des Tumors eines einzelnen Patienten informiert. Um genetische Merkmale zu identifizieren, die das Überleben nach DNA-Schäden regulieren, führen wir hier eine umfassende Profilierung der zellulären Überlebensrate nach Strahlenexposition in einer vielfältigen Sammlung von 533 genetisch annotierten menschlichen Tumorzelllinien durch. Wir zeigen, dass die Empfindlichkeit gegenüber Strahlung durch signifikante Variationen zwischen und innerhalb von Linien gekennzeichnet ist. Wir kombinieren Ergebnisse unserer Plattform mit genomischen Merkmalen, um Parameter zu identifizieren, die die Strahlenempfindlichkeit vorhersagen. Wir identifizieren somatische Varianten in der Kopienanzahl, Genmutationen und die basale Expression einzelner Gene und Gen-Sets, die mit dem Überleben bei Strahlung korrelieren, und enthüllen neue Einblicke in die genetische Basis der zellulären Tumorreaktion auf DNA-Schäden. Diese Ergebnisse demonstrieren die Vielfalt der zellulären Tumorreaktionen auf ionisierende Strahlung und etablieren mehrere Beweise dafür, dass neue genetische Merkmale, die die zelluläre Reaktion nach DNA-Schäden regulieren, identifiziert werden können.