Détection des vecteurs de moustiques envahissants utilisant l'ADN environnemental (eDNA) à partir d'échantillons d'eau

Des introductions répétées et la propagation d'espèces de moustiques envahissants (IMS) ont été enregistrées à grande échelle ces dernières décennies dans le monde entier. Dans ce contexte, des membres du genre de moustiques Aedes peuvent présenter des risques sérieux pour la santé publique, car ils ont ou peuvent développer une compétence vectorielle pour diverses maladies virales. Alors que le moustique tigre (Aedes albopictus) est un vecteur bien connu par exemple des virus de la dengue et du chikungunya, le moustique des buissons asiatiques (Ae. j. japonicus) et Ae. koreicus ont montré une compétence vectorielle sur le terrain et en laboratoire pour un certain nombre de virus, y compris la dengue, la fièvre du Nil occidental et l'encéphalite japonaise. La détection et l'identification précoces sont donc cruciales pour des stratégies d'éradication ou de contrôle réussies. L'identification spécifique traditionnelle et le suivi des différentes étapes de vie et/ou cryptiques des espèces de Aedes envahissantes sur des bases morphologiques peuvent conduire à des erreurs d'identification et posent problème lorsque une surveillance extensive est nécessaire. Dans cette étude, nous avons développé, testé et appliqué une approche d'ADN environnemental (eDNA) pour la détection de trois IMS, basée sur des échantillons d'eau collectés sur le terrain dans plusieurs pays européens. Nous avons comparé des essais de PCR quantitative en temps réel (qPCR) spécifiques à ces trois espèces et une approche de métabarcodage eDNA avec un échantillonnage traditionnel, et avons discuté des avantages et des limites de ces méthodes. Les probabilités de détection pour les approches basées sur l'eDNA étaient, dans la plupart des comparaisons spécifiques, plus élevées que pour le relevé traditionnel et les résultats étaient congruents entre les deux méthodes moléculaires, confirmant la fiabilité et l'efficacité des techniques alternatives basées sur l'eDNA pour la détection précoce et non ambiguë et la surveillance des vecteurs de moustiques envahissants. La facilité des procédures d'échantillonnage de l'eau dans l'approche eDNA testée ici permet le développement de programmes de surveillance et de suivi à grande échelle pour les IMS, notamment en utilisant des projets de science citoyenne.