L'API Proteins : accès à des informations clés intégrées sur les protéines et le génome

L'API Proteins fournit un accès de recherche et programmatique aux données sur les protéines et la génomique associée, telles que les annotations positionnelles de séquence de protéines curées provenant de UniProtKB, ainsi que les variations mappées et les données de protéomique provenant de grandes sources de données (LSS). En utilisant le service de coordonnées, les chercheurs peuvent récupérer les coordonnées de séquence génomique pour les protéines dans UniProtKB. Ainsi, les données de génomique et de protéomique LSS pour les protéines UniProt ne sont disponibles programmatique que par ce service. Une interface Swagger a été implémentée pour fournir de la documentation, une interface pour les utilisateurs, avec peu ou pas d'expérience en programmation, pour 'échanger' avec les services afin de formuler rapidement et facilement des requêtes et d'obtenir du code source généré dynamiquement pour les langages de programmation populaires, tels que Java, Perl, Python et Ruby. Les résultats de recherche sont renvoyés sous forme d'objets de données JSON, XML ou GFF standard. L'API Proteins est un service RESTful évolutif, fiable, rapide et facile à utiliser qui fournit une large ressource d'informations sur les protéines pour que les utilisateurs posent des questions basées sur leur domaine d'expertise, leur permettant d'obtenir un aperçu intégré des annotations protéiques disponibles pour les aider à améliorer leurs connaissances sur les protéines dans les processus biologiques. L'API Proteins est disponible à (http://www.ebi.ac.uk/proteins/api/doc).