Identifizierung von Verzerrungen und deren potenziellen Lösungen in Studien zum menschlichen Mikrobiom

Fortschritte in der DNA-Sequenzierungstechnologie haben die Fähigkeit der Forscher, die mikrobiellen Einwohner des menschlichen Körpers zu erforschen, erheblich verbessert. Leider führen diese Studien, obwohl sie die Bedeutung dieser mikrobiellen Gemeinschaften für unsere Gesundheit aufgedeckt haben, häufig nicht zu ähnlichen Ergebnissen. Ein möglicher Grund für die Diskrepanz in diesen Ergebnissen sind die zahlreichen systematischen Verzerrungen, die während sequenzbasierter Mikrobiom-Studien eingeführt werden. Diese Verzerrungen beginnen mit der Probenentnahme und werden während des gesamten Experiments fortlaufend eingeführt, was zu einer beobachteten Gemeinschaft führt, die signifikant von der wahren zugrunde liegenden mikrobiellen Zusammensetzung abweicht. In diesem Überblick werden wir die verschiedenen Schritte in typischen sequenzbasierten Studien zum menschlichen Mikrobiom hervorheben, bei denen signifikante Verzerrungen eingeführt werden können, und wir werden die aktuellen Bemühungen innerhalb des Feldes überprüfen, die darauf abzielen, die Auswirkungen dieser Verzerrungen zu reduzieren. Video-Abstract.