Dynamik der normalen Darmmikrobiota: Eine einjährige Längsschnittstudie in der schwedischen Bevölkerung

Die zeitliche Dynamik der Darmmikrobiota kann die Identifikation mikrobieller Merkmale, die mit dem Gesundheitsstatus assoziiert sind, einschränken. Hier verwendeten wir Ganzgenom-Metagenomik und 16S rRNA-Gen-Sequenzierung, um die intra- und interindividuellen Variationen der Zusammensetzung und des funktionellen Potenzials der Darmmikrobiota einer gesunden schwedischen Population (n = 75) über ein Jahr hinweg zu charakterisieren. Wir fanden heraus, dass 23 % der Gesamtvarianz in der Zusammensetzung durch intraindividuelle Variation erklärt wurden. Das Ausmaß der intraindividuellen Zusammensetzungsvariabilität war negativ mit der Häufigkeit von Faecalibacterium prausnitzii (einem Butyratproduzenten) und zwei Bifidobacterium-Arten assoziiert. Im Gegensatz dazu variierte die Häufigkeit fakultativ-anaerober und aerotoleranter Bakterien wie Escherichia coli und Lactobacillus acidophilus stark, unabhängig von der Stabilität der Zusammensetzung. Der Beitrag der intraindividuellen Varianz zur Gesamtvarianz war für funktionelle Stoffwechselwege größer als für mikrobielle Spezies. Daher erfordert eine verlässliche Quantifizierung mikrobieller Merkmale wiederholte Proben, um intraindividuelle Variationen der Darmmikrobiota zu berücksichtigen.