Strukturgeleitete Identifizierung eines kleinen Moleküls, das den anaeroben Cholinmetabolismus durch menschliche Darmbakterien hemmt

Der anaerobe mikrobielle Weg im Darm, der Cholin in Trimethylamin (TMA) umwandelt, ist weitreichend mit menschlichen Krankheiten verbunden. Hier beschreiben wir die Entdeckung, dass Betainaldehyd die TMA-Produktion aus Cholin durch menschliche Darmbakterienisolat und eine komplexe Darmgemeinschaft hemmt. In-vitro-Tests und eine Kristallstruktur deuten darauf hin, dass Betainaldehyd das mikrobielle Enzym Cholin-TMA-Lyase (CutC) im Darm anvisiert. In unserem System beobachten wir keine Aktivität des zuvor berichteten CutC-Hemmers 3,3-Dimethylbutanol (DMB). Der Arbeitsablauf, den wir zur Identifizierung und Charakterisierung von Betainaldehyd etablieren, bietet einen Rahmen zur Entwicklung zusätzlicher Inhibitoren des mikrobiellen Cholinmetabolismus im Darm, einschließlich therapeutischer Kandidaten.