Metagenomische Bewertung der Pilzvielfalt in den Mangroven-Sedimenten von Nord- und Zentral-Kerala, Indien

Die Pilzgemeinschaften der Mangrovensedimente haben eine große ökologische Bedeutung und sind aktiv am Nährstoffrecycling, der Zersetzung von Biomasse und der Abbaustoffe von schwer abbaubaren Substanzen beteiligt. Die vorliegende Studie konzentrierte sich auf den Vergleich der Häufigkeit, Diversität und Zusammensetzung der Pilzgemeinschaft in den Sedimenten zweier ausgewählter Mangrovenökosysteme der Distrikte Kannur und Eranakulam in Kerala. Eine metagenomische Analyse der gesamten Sediment-DNA wurde auf einer Illumina-Sequenzierungsplattform unter Verwendung von Pilz-ITS-Primern durchgeführt. Die Anzahl der Operational Taxonomic Units (OTUs) und die Diversitätsindizes zeigten, dass die Mangroven-Sedimente von Eranakulam eine höhere Pilzhäufigkeit, Artenreichtum und Diversität aufwiesen als die Mangroven-Sedimente von Kannur. Ascomycota war das am häufigsten identifizierte Phylum, und insgesamt wurden 11 Klassen, 20 Ordnungen, 34 Familien und 36 Gattungen aus den Mangrovensedimenten erhalten. Talaromyces, eine Gattung, die nicht häufig aus indischen Mangroven berichtet wird, war die prominenteste Gattung, die in unserer Studie gefunden wurde. Die Diversitätsheatmap zeigte, dass 16 Gattungen exklusiv in den Mangrovensedimenten von Eranakulam vorkamen, während 5 Gattungen exklusiv in den Mustern von Kannur vorkamen. Die metagenomischen Daten der Mangrovensedimente in unserer Studie offenbarten das Vorhandensein vieler Pilzstämme mit großem biotechnologischen Potenzial, die weiter im Technologischen Fortschritt erforscht werden können.